ミニバトル

コースにある扉に入ることでミニバトルができます。
バトルに勝利すると、スペシャルアイテムがもらえたり、ヨッシーの残機を増やすことができます。
※コース選択画面で以下の隠しコマンドを入れればいつでもプレイできます。
　SNES版：SELECTを押しながらX→X→Y→B→A
　GBA版：SELECTを押しながらL→L→B→A→R

フーセンなげ4

徐々に膨らんでいく風船を投げあって、持っているときに割れてしまったほうが負けというゲームです。
画面上に表示されている4つのキーを順番どおり入力することで相手に風船を渡すことができます。
キー入力には時間制限があり、メーターがいっぱいになるまでの間に急いですべてのキーを入力しないといけません。

フーセンなげ6

フーセンなげ4より難易度が上がり、キーが6個になったバージョンです。
制限時間は4のときと同じです。

フーセンわり

ヒップドップで風船を割っていき、先に当たりを引いたほうが勝ちになります。
当たりの位置はランダムで、相手が最初に割る風船に入っていてどうやっても勝てないこともあります。
相手を踏むと少し弾き飛ばすことができます。とくに上の段から落とすことができれば、かなり時間を稼ぐことができます。

たねはきバトル

スイカのタネを吐いて攻撃し、先に4ポイントダメージを与えたほうの勝ちになります。
緑スイカは1回の攻撃につき1ダメージですが、たまに出てくる赤スイカは2ダメージを与えられます。
さらにツボも貫通して攻撃できるので、優先的に取りましょう。

コインひろい

落ちてくるコインを相手よりも多く取れば勝ちになります。
相手を踏むと少しひるませることができます。
また、プレイヤー側は舌を使って取ることができるので、敵を踏んでハイジャンプしつつ舌で先に取ってしまいましょう。